「ゲゲゲの鬼太郎 全国妖怪大戦」では、プレイヤーは自分自身に力はないけれども妖怪の力を引き出すことができる半妖として、日本のある地方に暮らしている。そこに、鬼太郎と目玉おやじから緊急の要請が入り、強大な妖魔の復活に備えて仲間を集めて腕を磨く旅に出ることとなる。
ゲーム内では、昔懐かしいシリーズから最新のものまで、おなじみの妖怪たちがカードになって登場し、プレイヤーはそれらをクエストやバトルで強化して妖気を貯め、プレイヤー同士の対抗戦などで腕を試すことができる。さらに、本作限定の描き下ろしイラストも多数用意されており、ゲームを一層盛り上げていく。
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