セガゲームスは、2015年12月23日に発売を予定しているニンテンドー3DS用ソフト「セガ3D復刻アーカイブス2」について、収録タイトルにセガ・マークIII/マスターシステム版「ファンタジーゾーン」を追加すると発表した。
10本目の収録タイトルとなる「ファンタジーゾーン」の出現条件は、前作「セガ3D復刻アーカイブス」を遊んだことがあるニンテンドー3DSで、本作「セガ3D復刻アーカイブス2」をプレイすること。これにより、すでに発表しているボーナス収録タイトル「ファンタジーゾーンII」「メイズウォーカー」の2作に加え、新たにマークIII版「ファンタジーゾーン」が追加される。
このボーナス版「ファンタジーゾーン」は、マークIII版の忠実な移植に加え、3D立体視への対応、FMサウンド対応、アーケード版と同等の「レーダー表示」機能、ショットパワーがアップするなどより快適なプレイをサポートする「ヘルパーモード」機能が新たに搭載されている。