レベルファイブとカプコンは、2012年11月29日発売予定のニンテンドー3DS用ソフト「レイトン教授VS逆転裁判」について、ダウンロード版を同時発売すると発表した。ダウンロード版の価格は、パッケージ版と同じく5,980円（税込）。
本作では、考古学者 エルシャール・レイトンと、弁護士 成歩堂龍一が、書かれた物語が現実になる異世界・ラビリンスシティの謎と、魔女裁判に挑む。
レイトン教授のアドベンチャーパートでナゾを解き、成歩堂の裁判パートで異世界の裁判に挑戦。成歩堂や真宵がナゾに挑戦したり、一度に複数の証人を相手に、尋問を行う群衆裁判など、本作ならではの要素も多数盛り込まれた作品となっている。
※ダウンロード版を保存するのに必要なSDカードの空き容量は「最大918MB（7342ブロック）」です。
※ダウンロード版に早期購入者特典はつきません。
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